Căn cứ vào truyền ngôn dân gian, thần tích và các văn bia cổ còn lưu giữ, Chùa Trùng Quang (Quỳnh Lâm Tự) có niên đại khởi dựng từ thời Lý. Trải qua gần mười thế kỷ với biết bao thăng trầm lịch sử, ngôi chùa là nhân chứng vật thể ghi dấu nhiều sự kiện trọng đại của triều đình và quê hương:
Thời Lý - Trần: Khởi dựng từ thời Lý trên gò đất cao ven dòng Tùng Khê, ngôi chùa nhanh chóng trở thành trung tâm Phật giáo quy mô của xứ Sơn Tây, nơi hoằng dương chính pháp và gắn kết cộng đồng cư dân nông nghiệp cổ truyền vùng Mỗ.
Niên đại 1519 (Lê sơ): Năm Kỷ Mão (1519), trong bối cảnh triều đình Lê sơ biến động chính trị dữ dội trước sự thao túng của quyền thần Mạc Đăng Dung, Vua Lê Chiêu Tông đã từng lánh nạn và lưu trú tại Chùa Trùng Quang. Sự kiện lịch sử đặc biệt này được ghi nhận qua sự hiện diện của pho tượng 'Công chúa Lê triều' được tôn trí phụng thờ trang trọng riêng biệt trong chốn Tam Bảo cho đến tận ngày nay.
Đầu thế kỷ XVIII (Thời Lê Trung Hưng): Danh nhân Thám hoa Nguyễn Quý Đức (khi giữ chức Tham tụng / Tể tướng triều Lê - Trịnh) sau khi trí sĩ đã phát tâm công đức tiền tài ruộng đất đứng ra đại trùng tu chùa với quy mô bề thế vượt trội. Ông cho tôn tạo Thượng điện, Tiền đường, Hành lang, Tam quan, gác chuông và chế tác chiếc Khánh đá cổ kỷ lục có niên hiệu Vĩnh Thịnh thứ 7 (1705).
Năm Cảnh Hưng thứ 23 (1762): Nhân dân và các môn đồ đã khắc dựng tấm bia đá xanh lớn mang tên 'Trùng Quang tự bi' (kích thước 140cm x 66cm x 28cm) đặt tại Tiền đường để ghi chép chi tiết công đức to lớn của vị danh nhân văn hóa Tể tướng Nguyễn Quý Đức và các bậc tiền nhân trong sự nghiệp hưng long Phật pháp.
Thế kỷ XIX (Thời Nguyễn): Chùa tiếp tục được các thế hệ tăng ni, phật tử và Nhân dân địa phương công đức tu sửa, đúc thêm 02 quả chuông đồng lớn mang hoa văn tứ linh và chạm khắc hệ thống hoành phi câu đối sơn son thếp vàng ca ngợi cảnh giới thanh tịnh, trường tồn.
Giai đoạn hiện đại (1993 - Nay): Sau khi được Bộ Văn hóa - Thông tin xếp hạng Di tích Quốc gia năm 1993, chính quyền và Nhân dân phường Tây Mỗ đã tiến hành phục hồi cổng Tam quan, tôn tạo Nhà Mẫu, Nhà Tổ, chỉnh trang sân vườn, bảo tồn nguyên vẹn các bảo vật đá và đưa di tích trở thành điểm sáng văn hóa tâm linh gắn với chuyển đổi số thông minh.